În perioada otomană, în oraşul Chilia au funcţionat mai multe obiective de cult musulman. Cea mai cunoscută moschee se găsea în interiorul fortificaţiei de piatră. Pe planurile întocmite de inginerul francez François Kauffer la sfârşitul secolului al XVIII-lea aceasta este numită „moscheea mare a sultanului” şi „moscheea sultanului Bayezid”. În documentele păstrate în Arhivele Otomane ale Prim-ministrului din Istanbul figurează şi cea de-a treia denumire a acestei moschei: „Sultan Bayezid Han Djami”. Prospectul-perspectivă al Chiliei realizat în 1770 de militarii ruşi înfăţişează o construcţie compactă cu minaret şi balconaş pentru muezin. În anii 1822-1823, moscheea sultanului Bayezid al II-lea a fost reconstruită în biserica Adormirea Maicii Domnului. Acest obiectiv de cult a fost demolat în 1947. Astăzi i s-a păstrat doar clopotniţa, dar aceasta se află într-o stare deplorabilă, fiind obturată din toate părţile de diferite clădiri şi gardul de piatră al portului fluvial. În 1659, episcopul catolic de Nicopole Filip Stanislavov scria că în mahalalele Chiliei au existat cinci moschei pentru tătari, toate lucrate din lemn. Pe planul din 8-9 octombrie 1794 inginerul Kauffer a indicat următoarele moschei aflate în Vorstadt: moscheea lui Kura efendi, Moscheea arabă şi moscheea lui Haci Ahmet. Pe un alt plan nedatat al lui Kauffer figurează alte două moschei orăşeneşti: mosheea lui Ismail aga şi moscheea din piaţa depozitului de provizie/depozitului de lemne. Conform documentelor păstrate în Arhivele Otomane ale Prim-ministrului din Istanbul, în Vorstadt au mai funcţionat două edificii de cult musulman: moscheea lui Mahmud aga în mahalaua carşi şi moscheea sultanului Orhan. Pe o placă comemorativă musulmană păstrată la Muzeul de Arheologie din Odesa este menţionată moscheea înălţată de Haci Abdi aga şi renovată de Haci Hassan Raif-efendi. O altă moschee a fost construită pe timpul sultanului Bayezid al II-lea în zona debarcaderului. Astăzi, nicio moschee nu mai există la Chilia.