В данной работе описывается определение состава патогенной микрофлоры в семенах тритикале 3 сортов местной селекции: Ingen 40, Ingen 54 и Ingen 93, с использованием метода молекулярно-генетической идентификации (nested-PCR analysis). Исследовались образцы семян урожая 2019 и 2020 годов, выращиваемые на опытном участке ИГФЗР, на наличие некоторых патогенных микромицетов из р. Fusarium, Penicillium и Alternaria alternata. Для идентификации патогенов видов Fusarium oxysporum, F. verticillioides, F. avenaceum, F. equiseti, F. incarnatum, F. sporotrichioides, Penicillium chrysogenum и P. еxpansum, Penicillium brevicompactum и Alternaria alternata были использованы специфичные праймеры, сконструированные в лаборатории молекулярной генетики ИГФЗР. Результаты ПЦР оценивали при помощи электрофоретического разделения продуктов амплификации в 1,5% агарозном геле. Сравнивая присутствие анализируемых патогенов в образцах семян разных сортов по годам, установили, что представители р. Fusarium были идентифицированы только у сорта Ingen 93: в 2019 - Fusarium avenaceum и Fusarium nivali, а в 2020 - Fusarium sporotrichioides. Тестирование образцов на фитопатогены рода Penicillium показало его наличие во всех пробах семян. Penicillium chrysogenum был идентифицирован в образцах семян сорта Ingen 40 урожая 2019 и 2020 годов, а также в семенах Ingen 93 и Ingen 54 сбора 2019 года и 2020 года, соответственно. Анализ семян на наличие Penicillium expansum показал присутствие фрагментов ожидаемой длины в 5 из 6 исследованных образцов. Таким образом, применение тестирования ДНК тритикале методом nested-PCR позволяет идентифицировать наличие в семенах патогенной микрофлоры, что может предотвратить негативный эффект от их использования путем отбраковки, а также отследить появление патогенов во время вегетации растений тритикале в поле и принять необходимые превентивные меры.

Triticale as an artificially synthesized hybrid assumes a combination of high taste and nutritional qualities of wheat with the unpretentiousness and resistance of rye. However, in recent years, there is more and more data on the widening the spectrum of fungal pathogens in triticale plants, inherent in both wheat and rye, which lead to loss of yield and a decrease in the sowing quality of seeds. In addition, fungi contaminate grain with toxic metabolites which is very dangerous to health. This work describes the determination of the composition of pathogenic microflora in seeds of triticale of 3 varieties of local breeding: Ingen 40, Ingen 54 and Ingen 93, by the method of molecular genetic identification (nested PCR analysis). We studied samples of the harvest of 2019 and 2020, grown in the experimental field of IGPPP, for the presence of some pathogenic micromycetes from g. Fusarium, Penicillium and Alternaria alternata. To identify pathogens of the species Fusarium oxysporum, F. verticillioides, F. avenaceum, F. equiseti, F. incarnatum, F. sporotrichioides, Penicillium chrysogenum and P. expansum, Penicillium brevicompactum and Alternaria alternata, specific primers were designed and used in the Molecular Genetic Lab of IGPPP. The results of PCR were evaluated by electrophoretic separation of amplified products in 1.5% agarose gel. Comparison of the presence of the analyzed pathogens in seed samples of different varieties allowed to find that representatives of the g. Fusariums were identified only in the Ingen 93 variety: in 2019 - Fusarium avenaceum and Fusarium nivalе, and in 2020 - Fusarium sporotrichioides. Testing for phytopathogens of the genus Penicillium showed its presence in all seed samples. Penicillium chrysogenum has been identified in seed samples of Ingen 40, harvests 2019 and 2020, and Ingen 93 and Ingen 54, harvests 2019 and 2020, respectively. Analysis of seeds for the presence of Penicillium expansum showed the presence of fragments of the expected length in 5 out of 6 studied samples. Thus, the use of triticale DNA testing by the nested PCR method allows identifying the presence of pathogenic microflora in seeds, which can prevent the negative effect of their use by rejection. Moreover, it makes it possible to detect the appearance of pathogens during the growing season of triticale in the field and to take the necessary preventive measures.