Бактериопланктон определяет трансформацию и минерализацию органических веществ (ОВ) в экосистеме и благодаря своей чувствительности быстро реагирует увеличением своей численности при появлении в водоеме дополнительного количества аллохтонного ОВ или отмирании автохтонного ОВ [1]. По результатам современных исследований, за счет деструкционной деятельности бактерий в морских экосистемах утилизируется 40–80% органического углерода, создаваемого первичными продуцентами [2]. Вместе с этим бактерии утилизируют загрязняющие ОВ, которые попадают в водоёмы в результате хозяйственной деятельности человека, что служит основанием для использования показателя численности бактериопланктона в качестве индикации степени эвтрофированности водоёмов [3]. Днестровский лиман в полной мере ощущает влияние антропогенных факторов [4], которые формируются расположенными на его берегах городами Белгород-Днестрвский, Овидиополь с. Шабо и большого рекреационного комплекса Затока-Каролино-Бугаз. Регулярные наблюдения за количественными изменениями бактериоплнктона в Днестровском лимане были начаты сотрудниками Регионального центра интегрированного мониторинга и экологических исследований Одесского национального университета им. И.И. Мечникова в 2003 г. и продолжают проводиться до настоящего времени [5-11]. Целью настоящей работы была оценка индикаторного значения бактериопланктона и его связей с потенциальными источниками органического вещества в Днестровском лимане.