Богословское наследие митрополита Петра Могилы оказало огромное влияние на российскую церковную традицию. Синодальная эпоха явилась наиболее благоприятным временем для этого. Политические интересы имперских властей требовали проведения церковных реформ, для которых были необходимы интеллектуальные источники. В первую очередь, российскую власть устраивал антиуниатский вектор сочинений Могилы, что отвечало политическим интересам Империи в ХVIII–XIX вв. В начале ХХ века на исходе синодального периода в Российской церкви началась широкая дискуссия об освобождении от чуждого ее духу католического влияния. Антиуниатские сочинения митрополита Петра утратили свою былую актуальность из-за отсутствия в них существенной критики католических догматов. Кроме того, такие авторитетные православные богословы, как о. Георгий Флоровский, усматривали в его трудах скрытое униатство. «Парижская школа» русского зарубежья выступила с критикой сочинений Могилы и образа жизни, не подобающего православному иерарху. Полонофильство митрополита также не осталось незамеченным церковными историками. В 1996 году иерарх был канонизирован УПЦ МП, несмотря на отрицательный отзыв их Синодальной комиссии. В 2005 патриарх Алексий II благословил внести имя митрополита Петра в общецерковный календарь. В современном российском православии его почитание расценивают как уступку украинскому церковному сепаратизму, продолжением пагубного греко-католическоо влияние на церковную традицию, что невозможно не оценить как определенную историческую иронию над борцом с унией. Тем не менее, в православном обиходе до сих остается востребованной книгой Требник митрополита Петра, содержащей чин экзорцизма.