Фосфор, содержащийся в навозе, при стоке может оказывать значительное воздействие на качество пресноводных озер и рек. Содержание фосфора в навозе свиней и птицы высоко, поскольку они потребляют корма, содержащие зерно и семена масличных культур. Присутствующая в них большая доля фосфора (от 60 до 80 процентов) не усваивается пищеварительным трактом и выделяется в виде экскрементов. В результате в рационе питания свиней и птицы должно быть много фосфора с тем, чтобы удовлетворять их потребности в этом элементе. Подобной проблемы не наблюдается у жвачных животных - крупного рогатого скота, овец и коз, поскольку их пищеварительный тракт лучше приспособлен к употреблению содержащегося в кормах фосфора. Для решения этой проблемы применительно к свиньям и птице, была создана специальная разновидность генетически модифицированной кукурузы, которая делает содержащийся в кормах фосфор более приемлемым для животного. Этот сорт генетически модифицированной кукурузы открывает потенциальные возможности дальнейшего сокращения выделения фосфора свиньями и курами. Была также разработана аналогичная разновидность генетически модифицированных соевых бобов. Корма из этого сорта генетически модифицированных соевых бобов обеспечивают свиньям и птице более высокое содержание фосфора в рационе, чем, корма, состоящие из обычных соевых бобов. Исследования показывают, что рационы питания, содержащие генетически модифицированную кукурузу, и корма, составленные из генетически модифицированных соевых бобов, сокращают количество выделяемого фосфора в навозе свиней и кур на 50-60 процентов. Включение этих специальных сортов генетически модифицированной кукурузы и генетически модифицированных соевых бобов в рацион питания свиней и кур открывает очень большие возможности резкого сокращения количества фосфора, выделяемого в окружающую среду.