В Молдове более двух столетий проводятся исследования различных направлений болгаристики. Первоначально местные авторы публикуют материалы о бессарабских болгарах в кишиневских и одесских изданиях. К концу ХIХ в. значительный вклад в исследовании средневековой Болгарии вносят ученые А. Яцимирский и П. Сырку. На рубеже веков многое делается для изучения болгарских сел и расположенных в них церквей. Известный кишиневский общественный деятель болгарин И. Иванов публикует сборник об освободительной борьбе болгар. В межвоенный период продолжается интерес к истории и культуре болгарских переселенцев. Одновременно на Богословском факультете в Кишиневе проф. Петру Константинеску-Яшь успешно занимается проблемами болгарского Возрождения. В послевоенный период, к середине 50-х гг. ХХ в., появляются труды И. Мещерюка и Е. Руссева, которые раскрывают формирование и развитие болгарской диаспоры в Бессарабии. Проблемы языковой и культурной болгаристики планировалось изучать в гагаузско-болгарской комиссии при Молдавском филиале АН СССР. Особенно углубленно историческая болгаристика исследовалась в Отделе истории социалистических стран Института истории АНМ. В его рамках сформировалась группа (К. Поглубко, И. Забунов, Л. Степанова, Н. Червенков, И. Грек, К. Жигня), которая занималась проблемами истории, культуры, болгаророссийско-молдавских связей. Она подготовила и издала авторские и коллективные монографии. Тем самым Кишинев стал одним из крупных центров болгаристики. Практически шел процесс складывания условий для создания академического подразделения болгаристики. Именно группа стала основой для открытия отдела по изучению болгарской тематики в рамках созданного в начале 1990-х гг. Института межэтнических исследований АНМ. Перед данным отделом была поставлена задача непосредственного изучения проблем, связанных с болгарским населением республики.