Introducere: Supradozarea de antibiotice reprezintă un contribuitor major la apariția rezistenței la antibiotice la nivel global, ceea ce impune implementarea de inițiative de gestionare a acestora în industria medicală. Datorită gamei variate de antibiotice disponibile, abordările de tratament variază semnificativ între țări în ceea ce privește medicamentul utilizat, doza și durata terapiei, având un impact semnificativ asupra rezistenței la antibiotice. Pentru a explora comunitatea microbiană și a descrie corect impactul profilaxiei cu antibiotice asupra microbiotei intestinale, sunt deseori necesare abordări moleculare de rezoluție înaltă. Alegerea unei metode de extracție a ADN-ului sensibilă și reproductibilă, care să faciliteze izolarea ADN-ului microbian în cantitate și puritate suficientă din toate speciile microbiene existente în probă, este esențială pentru detectarea evenimentelor de disbioza, precum și pentru măsurarea abundenței diferitelor specii bacteriene din cadrul unei probe. Materiale și metode: S-a realizat un studiu transfrontalier prospectiv pentru a evalua modificările în microbiota intestinală înainte și după intervenții chirurgicale oncologice elective colorectale pentru 70 de pacienți adulți cu diferite scheme de profilaxie antimicrobiana (profilaxie standard cu cefuroxima/metronidazol versus regimuri non-profilactice care implică combinații multiple de medicamente, precum cefazolina, cefoperazona-sulbactam, cefotaximă și ceftriaxonă). S-a efectuat analiza metataxonomică pe baza secvențierii NGS a genei bacteriene 16S rRNA în mostre de fecale obținute de la pacienți înainte de intervenția chirurgicală și la 7 zile după intervenție. Similaritățile și diferențele între comunitățile bacteriene au fost evaluate utilizând atât indici de diversitate alfa, cât și beta. Procesarea datelor a inclus generarea unei matrici de disimilaritate Bray-Curtis, analiza coordonatelor principale și PERMANOVA. Rezultate și concluzii: în grupul de studiu, compoziția microbiotei intestinale nu s-a schimbat semnificativ la o săptămână după tratamentul cu cefuroxima în comparație cu profilaxia care a implicat alte combinații de antibiotice, unde am observat o scădere a diversității taxonomice. Modificările cauzate de antibiotice pot genera un efect măsurabil asupra comunității bacteriene din colonul uman, având un impact important asupra stării de sănătate.

Introduction: Antibiotic overuse is a major contributor to the emergence of antibiotic resistance worldwide, which calls for the implementation of antibiotic stewardship initiatives in the healthcare industry. Due to the large variety of clinically available antibiotics, treatment approaches vary greatly between countries in terms of medication type, dosage and duration of therapy, all having a substantial impact on antibiotic resistance. To appropriately explore the microbial community and correctly describe the impact of antibiotic prophylaxis on the gut microbiota, high-resolution molecular approaches are often essential. This includes finding a sensitive and reproducible DNA extraction method that facilitates isolation of microbial DNA of sufficient quantity and purity from all the existent microbial species in the sample, as well as determining the abundance of different bacterial taxa inside samples. Material and method: We conducted a cross-border prospective study to evaluate the changes in the gut microbiota before and after elective oncologic colorectal surgery on 70 adult patients with different antimicrobial prophylaxis regimens (standard prophylaxis with cefuroxime/metronidazole versus nonprophylactic regimes involving multiple drug combinations of cefazolin, cefoperazone-sulbactam cefotaxime and ceftriaxone). We performed metataxonomic analysis based on NGS sequencing of the bacterial 16S rRNA gene on fecal smears obtained preoperative and 7 days postoperative from the patients. Similarities and differences between bacterial communities were assessed using both alpha and beta diversity indices. Data processing included the generation of a Bray-Curtis dissimilarity matrix, principal coordinates analysis and PERMANOVA. Results and conclusions: In our study group, the intestinal microbiota composition was not significantly changed one week post cefuroxime treatment compared to the prophylaxis involving other antibiotic combinations, where we observed a loss in taxonomic variety. Modifications caused by antibiotics can produce a measurable effect on the human colonic bacterial community, having an important impact on health status.