Болезнь Паркинсона (БП) — это хроническое прогресcирующее нейродегенеративное заболевание головного мозга, преимущественно связанное с дегенерацией дофаминергических нейронов черной субстанции [Левин, Федорова, 2012]. Большинство случаев БП носит спорадический характер и лишь у 5-10% пациентов наблюдают моногенные формы БП, вызванные редкими высоко пенетрантными мутациями, сегрегирующими с заболеванием в семьях. При аутосомно-доминантном типе БП обнаруживают мутации в генах SNCA, LRRK2 и VPS35; аутосомно-рецессивном – в генах PINK1, DJ-1, Parkin [Lill, 2016]. Несмотря на активные многолетние исследования причин возникновения БП, к настоящему времени невыясненным остается ряд важных вопросов, связанных с патогенезом заболевания. Одним из эффективных подходов поиска новых генов, вовлеченных в развитие БП, является полное экзомное секвенирование. В данной работе проведено секвенирование полного экзома десяти пациентов с болезнью Паркинсона. Пациенты отбирались с использованием международной унифицированной шкалы БП (Unified Parkinson’s Disease Rating Scale, UPDRS) и шкалы Хен и Яра (Hoehn and Yahr scores) в РКБ им. Куватова. У каждого пациента с информированного согласия были взяты образцы периферической крови, выделена ДНК. В результате исследования у пациентов были обнаружены полиморфные варианты в ключевых генах БП – PINK1, DNAJC6, LRRK2, VPS13C, MAPT, PARK2, SYNJ1. В гене PARK2 выявлено 4 мутации. Отметим, что у 1 пациента одновременно встречались 2 мутации в гене PARK2 (p.T240M и p.V380L в гомо– и гетерозиготном состоянии, соответственно) и 1 гомозиготная мутация (p.S671N) в гене DNAJC6. У другого пациента встречались два гомозиготных варианта в гене LRRK2 (p.M239T, p.R50H). У одного пациента обнаружено несколько вариантов, повреждающих ген VPS13C. Секвенирование экзома пациентов также позволило выявить патогенные мутации в ряде генов, роль которых при БП не была описана ранее, но для определения их значимости в патогенезе БП необходимы дальнейшие исследования.
Parkinson's disease (PD) is a chronic progressive neurodegenerative disease of the brain, mainly associated with degeneration of dopaminergic neurons of black substance [Levin, Fedorova, 2012]. Most PD cases are sporadic and only approximately 5-10% of patients suffer from a monogenic form of PD where autosomal dominant mutations in SNCA, LRRK2, and VPS35 and autosomal recessive mutations in PINK1, DJ-1, and Parkin cause the disease with high penetrance. [Lill, 2016]. Despite active long-term studies of PD causes, a number of important problems related to the pathogenesis of the disease remain unclear. One of the effective approaches to find new genes involved in PD development is whole exome sequencing. (WES). We performed WES of ten PD patients with early-onset (≤40 years) and absence of a family history. Patients were enrolled in the investigation using the Unified Parkinson's Disease Rating Scale (UPDRS) and the Hoehn and Yahr scores. The samples of peripheral blood were taken from each patient with the informed consent in the Republic Clinical Hospital, Ufa. Several polymorphisms in the key PD genes were found in PD patients – PINK1, DNAJC6, LRRK2, VPS13C, MAPT, PARK2, SYNJ1. Four mutations were found in the PARK2 gene. We noted that 2 mutations in the PARK2 gene (p.T240M and p.V380L in the homo– and heterozygous state) and 1 homozygous mutation p.S671N in the DNAJC6 gene were detected in 1 patient. Another patient had two homozygous variants in the LRRK2 gene (p.M239T, p.R50H). One patient was compound heterozygous for variants affecting VPS13C gene. The WES also allowed to identify pathogenic mutations in several candidate genes, but further investigation is required to determine the role of these genes in PD.
|