Катастрофическое состояние водных запасов нижнего и среднего Днестра, причиной которого стали административное ограничение попуска воды из вышерасположенных водохранилищ украинских ГЭС, а также засушливые условия 2016 года стали целью изучения всего гидробиоценоза реки. Одним из наиболее важных звеньев экосистемы реки является бактериопланктон, результаты исследования, которого приведены в данной работе. Бактериальное звено, как известно, является наиболее чувствительным и быстро реагирующим компонентом гидробиоценоза. Количественные показатели развития и активности бактериопланктона исключительно вариабельны и зависят от большого числа факторов. По численности и физиологической активности бактерий можно с высокой долей достоверности оценить продукционно-деструкционный потенциал бактериального звена, трофический статус водоема и, наконец, его сапробиологическое состояние.