Alegerea corectă a metodologiei pentru oricare investigaţie este importantă, inclusiv în cazul asigurării securităţii inovaţionale și formării economiei inovaţionale, ca fenomen absolut nou al sistemului general şi al structurii securităţii naţionale. În acest articol, autorul îşi propune să interpreteze fenomenele: sistem şi inovare, corelându-le cu procesele caracteristice lumii contemporane. Autorul actualizează diferite interpretări ale proceselor inovaţionale, ale securităţii naţionale

Значение правильно выбранной методологии для любого исследования велико, а для изучения процесса обеспечения инновационной безопасности при формировании инновационной экономики как абсолютно нового феномена и явления в общей системе и структуре национальной безопасности крайне велико. В связи с этим в данной статье сделана попытка научно философского осмысления системности и инновационности происходящих процессов в современном мире, новой трактовки обеспечения безопасности инновационных процессов и обоснование, в контексте методов и методологии исследования, нового феномена национальной безопасности - системы инновационной безопасности и ее роли в создании и развитии национальной инновационной системы.