SSR маркеры, созданные на основе нуклеотидных последовательностей протеин киназных генов томата
Închide
Articolul precedent
Articolul urmator
552 3
Ultima descărcare din IBN:
2023-09-04 10:35
SM ISO690:2012
ЗАМОРЗАЕВА, Ирина, БАРБАКАР, Николай. SSR маркеры, созданные на основе нуклеотидных последовательностей протеин киназных генов томата. In: Biotehnologii avansate – realizări şi perspective: Simpozionul ştiinţific naţional cu participare internaţională, 24-25 octombrie 2013, Chişinău. Chișinău, Republica Moldova: Tipografia Academiei de Ştiinţe a Moldovei, 2013, Ediția III-a, p. 73.
EXPORT metadate:
Google Scholar
Crossref
CERIF

DataCite
Dublin Core
Biotehnologii avansate – realizări şi perspective
Ediția III-a, 2013
Simpozionul "Biotehnologii avansate – realizări şi perspective"
Chişinău, Moldova, 24-25 octombrie 2013

SSR маркеры, созданные на основе нуклеотидных последовательностей протеин киназных генов томата


Pag. 73-73

Заморзаева Ирина, Барбакар Николай
 
Institutul de Genetica şi Fiziologie a Plantelor
 
 
Disponibil în IBN: 20 martie 2020



Teza

Протеинкиназные гены, объединенные по структурным и функциональным особенностям в семейства, определяют целый ряд свойств живых организмов,в том числе растений.На томате функции различных протеин киназ изучены достаточно широко. Особое место занимают исследования, доказывающие участие протеин киназ в процессах, обеспечивающих растениям устойчивость к неблагоприятным факторам.В частности, показано увеличение экспрессии протеин киназыIтомата под влиянием повреждения растений грибной инфекцией либонасекомыми-вредителями. Важную роль в обеспечении иммунного ответа растений при повреждении бактериальной пятнистостью играют осуществляющие переход серин/треонинкиназы, кодируемые генами Pto, Pti1,Fen. Было показано, что в кодирующих участках некоторых протеин киназных генов томата содержатся простые повторяющиеся последовательности, или SSR. На их основе нами были созданы и проанализированы три молекулярных маркера:UMD-88 длиной 191 п.о. на основе гена рецептор-подобной протеин киназы 2 (LePKR2), UMD- 1958 длиной 208 п.о. на основе гена протеин киназы 4 (LePK4) и UMD-2781 длиной 184 п.о. на основе гена интерактора Pto-киназы (Pti 1). При конструировании маркеров их длина выбиралась с учетом того, что, с одной стороны, они должны быть сравнительно короткими, чтобы при анализе на электрофореграммах можно было зафиксировать разницу в размерах ампликонов хотя бы в три пары оснований. С другой стороны, маркеры не должны быть слишком короткими, иначе их сложно будет отделить на анализируемых гелях от димеров праймеров, которые в некотором количестве всегда образуются в процессе проведения ПЦР. Разделение продуктов амплификации проводилось на 2% агарозных гелях в 1× трис-боратном буфере. Анализ данных маркеров на восьми сортах томатов из коллекции ИГФР показал, что все они могут быть использованы для генотипирования растений. Во всех трех случаях была отмечена разница между длинами образовавшихся ампликонов, число аллелей составляло 2 (UMD-88) либо 3 (UMD-1958, UMD-2781). На агарозных гелях полосы для каждого маркера идентифицировались как «высокие», «средние» (кроме UMD-88) и «низкие». Оказалось, что электрофоретические полосы были в основном «высокими», что, по-видимому, соответствовало маркеру ожидаемого размера, без делеций в районе повтора. Только сорт «Глория» показал наличие «низких» полос (коротких аллелей) для всех трех протеин киназных маркеров. Известно, что этот сорт слабо используется в современных хозяйствах в связи со сложностями при хранении и транспортировке. Кроме того, этот сорт в значительной степени подвержен поражению вершинной гнилью, особенново влажные годы.«Средние» полосы идентифицированы для двух маркеров, UMD-88 и UMD-2781, у сорта «Катерина», сравнительно устойчивого к вершинной гнили, обладающего толстокожими плодами. По маркеру UMD-1958 «средние» полосы отмечены у сорта «Призер», хорошо хранящегося, но сильно подверженного поражению бактериальнойпятнистостью в неблагоприятные годы. Таким образом, мы делаем вывод о возможности генотипирования сортов томата с помощью предложенных протеин киназные маркеров. В дальнейших исследованиях планируется расширить количество изучаемых сортов, отличающихся по своим хозяйственно-ценным характеристикам.