În patogeneza autoimunizării creierului un rol aparte revine proteinelor encefalului, oligodendritelor, precum şi dereglării proceselor metabolice ale proteinelor, lipidelor, stării barei hematoencefalice etc. Studiul proteinelor specifice ale creierului, antigenilor sistemului histocompatibilităţii HLA şi implicarea lor în reacţiile imunologice în studierea patologiilor creierului se află în legătură cu procesele autoimune şi presupunem că autoimunizarea encefalului prezintă un risc în diminuarea proceselor cognitive.

The brain’s autoimmune attack makes the process of the autoimmunization with an essential lesion especially of the albumen, first of all having the intermediary role of the mutual reciprocal action of the oligodentrites between it and the neuroes. The appearance of the autoantigenes of the brain to the albumen causes disturbances of the brain’s physiological functions. In this way it lightens the process of learning and memorizing, which creates a limited risk of facilitation of the cognitive process.