Пшеница (Triticum aestivum L.) является одним из основных культурных злаковых растений по распространенности и использованию мировым сообществом.В конце ХХ века в практику исследования генетического разнообразия был включен новый класс молекулярных маркеров, получаемых в результате ферментативной амплификации ДНК с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), принцип которой был разработан Кэри Мюллисом (фирма “Cetus”, США) в 1983г. Молекулярно-генетический подход, используемый для анализа генома, позволяет изучать полиморфизм ДНК культурных растений. Исследования по полиморфизму ДНК растений, в свою очередь, помогают получать обширную информацию о генотипе. В настоящее время широко используется ISSR-метод (InterSimpleSequenceRepeat) для выявления внутривидового полиморфизма, в первую очередь у близкородственных генотипов культурных растений. При ISSR-ПЦР анализе микросателлитные последовательности используются в качестве праймеров в полимеразной цепной реакции для создания мультилокусных спектров. При расшифровке генома в ноябре 2012 года было установлено, чтогеном гексаплоидной пшеницы содержит 94,000-96,000 генов, 80% генома составляютповторяющиеся последовательности. В работе были опробованы ISSR праймеры на образцах пшеницы Института генетики и физиологии растений АНМ. Выделение ДНК проводили из пшеницы, выращенной в чашках Петри, при помощи набора для выделения ДНК фирмы Fermentas. Амплификацию ДНК осуществляли в термоциклере Multi Gene II Personal Thermal Cycler (фирма Bioer Technology) по программе для ISSR-метода. Температура отжига составляла 490С. Продукты амплификации разделяли электрофорезом в однократном трис-боратном буфере, в 1.5%-м агарозном геле, с последующим окрашиванием бромистым этидием и фотографированием в УФ свете. Для определения длины фрагментов ДНК использовали молекулярный маркер Gene Ruler 1kb DNA Ladder (фирма Fermentas).Каждый праймер индивидуально был проанализирован в ISSR- ПЦР с геномной ДНК пшеницы. Нами протестировано 12 образцов пшеницы на двух ISSR праймерах. Исследуемая ДНК пшеницы была представлена 4 сортами, 6 линиями и 2 мутантами. ISSR-праймеры представляют собой повторы нуклеотидов: М 3 –динуклеотид 5`- (GA)8(C/T)C(18 нуклеотидов) и М 9–пентануклнотид 5`- (GACAC)4 (20 нуклеотидов). Для каждого образца пшеницы был получен индивидуальный спектр ампликонов. М9ISSRпраймер в среднем амплифицировал от 2 до 4 фрагментов ДНК пшеницы, число ампликонов с М3 ISSR праймером составляло от 2 до 6 фрагментов на дорожку. Размеры амплифицированных фрагментов варьировали от 200 до 900 п.н. Для М9ISSR праймера полоса около 400 п. н. присутствовала во всех образцах, полоса в 700 п. н. присутствовала во всех образцах, кроме мутанта.Фрагмент в 580 п.н. не проявлялся в следующих образцах: в линиях 14, 17, 18, мутанте 8/1, сорте Centurk. Спектр ампликонов, полученных для М3 ISSR праймера, представляет для каждого образца специфичное сочетание ISSR фрагментов. Полоса в 230 п.н присутствует во всех образцах, в 420п.н- во всех, кроме сорта Centurk, полоса в 500 п.н. отсутствовала только в сорте Albidum 114, полоса в 650 п.н. отсутствовала в сортах Кавказ, Albidum 114, линии 16.Следует отметить, что исследуемый сорт Albidum 114 давал спектр ампликонов, отличающийся от всех остальных, использованных в данной работе, образцов пшеницы. Результаты данной работы подтверждают возможность использования ISSR-метода для выявления внутривидового полиморфизма ДНК у пшеницы.